Protein–RNA interactions for Protein: J3QPL3

Gm5225, Predicted gene 5225, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5225J3QPL3 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm5225J3QPL3 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5225J3QPL3 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5225J3QPL3 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5225J3QPL3 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5225J3QPL3 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5225J3QPL3 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5225J3QPL3 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5225J3QPL3 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5225J3QPL3 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5225J3QPL3 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5225J3QPL3 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5225J3QPL3 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5225J3QPL3 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5225J3QPL3 Entpd4-206ENSMUST00000184973 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5225J3QPL3 Entpd4b-204ENSMUST00000185072 3589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5225J3QPL3 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5225J3QPL3 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5225J3QPL3 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5225J3QPL3 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5225J3QPL3 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5225J3QPL3 Rps12-203ENSMUST00000218107 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5225J3QPL3 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5225J3QPL3 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5225J3QPL3 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5225J3QPL3 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5225J3QPL3 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5225J3QPL3 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5225J3QPL3 D030025P21Rik-202ENSMUST00000220643 3987 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5225J3QPL3 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5225J3QPL3 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5225J3QPL3 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5225J3QPL3 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5225J3QPL3 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5225J3QPL3 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5225J3QPL3 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5225J3QPL3 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5225J3QPL3 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5225J3QPL3 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5225J3QPL3 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5225J3QPL3 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5225J3QPL3 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5225J3QPL3 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5225J3QPL3 Arl13b-201ENSMUST00000089289 3528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5225J3QPL3 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5225J3QPL3 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5225J3QPL3 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5225J3QPL3 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Gm5225J3QPL3 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm5225J3QPL3 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm5225J3QPL3 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm5225J3QPL3 Nfib-203ENSMUST00000107245 9116 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm5225J3QPL3 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm5225J3QPL3 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm5225J3QPL3 Oit3-201ENSMUST00000009798 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm5225J3QPL3 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm5225J3QPL3 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm5225J3QPL3 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm5225J3QPL3 Phf8-205ENSMUST00000112668 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm5225J3QPL3 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm5225J3QPL3 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm5225J3QPL3 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm5225J3QPL3 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm5225J3QPL3 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm5225J3QPL3 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm5225J3QPL3 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm5225J3QPL3 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm5225J3QPL3 Gm29052-201ENSMUST00000187700 1451 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm5225J3QPL3 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm5225J3QPL3 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm5225J3QPL3 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm5225J3QPL3 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm5225J3QPL3 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm5225J3QPL3 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm5225J3QPL3 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm5225J3QPL3 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm5225J3QPL3 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm5225J3QPL3 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm5225J3QPL3 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm5225J3QPL3 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm5225J3QPL3 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Gm5225J3QPL3 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm5225J3QPL3 Lgals8-203ENSMUST00000124888 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm5225J3QPL3 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm5225J3QPL3 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm5225J3QPL3 Tmem201-202ENSMUST00000103208 3620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm5225J3QPL3 Thoc5-202ENSMUST00000101615 2116 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm5225J3QPL3 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm5225J3QPL3 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm5225J3QPL3 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm5225J3QPL3 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm5225J3QPL3 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm5225J3QPL3 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Gm5225J3QPL3 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm5225J3QPL3 Stau1-203ENSMUST00000109236 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm5225J3QPL3 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm5225J3QPL3 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm5225J3QPL3 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm5225J3QPL3 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm5225J3QPL3 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms