Protein–RNA interactions for Protein: J3QM54

Gm3727, Predicted gene 3727, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3727J3QM54 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Gm14132-201ENSMUST00000117188 1719 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 4933440M02Rik-203ENSMUST00000206609 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Exoc3l4-209ENSMUST00000222897 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 4921522P10Rik-201ENSMUST00000048606 2101 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Socs6-201ENSMUST00000070116 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Rad51b-202ENSMUST00000171210 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 AC126257.2-201ENSMUST00000215507 2300 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Zbtb24-205ENSMUST00000216656 2476 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Fcho1-201ENSMUST00000093444 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Nfia-202ENSMUST00000075448 9526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Madd-211ENSMUST00000111373 5641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Mpv17-209ENSMUST00000202241 903 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Zfp362-202ENSMUST00000106072 2812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Zfp46-201ENSMUST00000069195 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Arrb1-201ENSMUST00000032995 3715 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Lsp1-211ENSMUST00000149521 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Gm3727J3QM54 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
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