Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9F7

Ccdc146, Coiled-coil domain-containing 146, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc146E9Q9F7 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc146E9Q9F7 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc146E9Q9F7 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc146E9Q9F7 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc146E9Q9F7 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc146E9Q9F7 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc146E9Q9F7 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc146E9Q9F7 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc146E9Q9F7 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc146E9Q9F7 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc146E9Q9F7 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc146E9Q9F7 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc146E9Q9F7 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc146E9Q9F7 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc146E9Q9F7 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc146E9Q9F7 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc146E9Q9F7 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc146E9Q9F7 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc146E9Q9F7 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc146E9Q9F7 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc146E9Q9F7 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc146E9Q9F7 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc146E9Q9F7 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc146E9Q9F7 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc146E9Q9F7 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc146E9Q9F7 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc146E9Q9F7 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc146E9Q9F7 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc146E9Q9F7 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc146E9Q9F7 Fbln7-202ENSMUST00000110324 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc146E9Q9F7 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc146E9Q9F7 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc146E9Q9F7 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc146E9Q9F7 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc146E9Q9F7 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc146E9Q9F7 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc146E9Q9F7 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc146E9Q9F7 Apoc1-202ENSMUST00000108451 532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc146E9Q9F7 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc146E9Q9F7 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc146E9Q9F7 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc146E9Q9F7 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc146E9Q9F7 Gm3890-201ENSMUST00000182416 207 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc146E9Q9F7 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc146E9Q9F7 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc146E9Q9F7 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc146E9Q9F7 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc146E9Q9F7 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc146E9Q9F7 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc146E9Q9F7 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc146E9Q9F7 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc146E9Q9F7 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc146E9Q9F7 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc146E9Q9F7 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc146E9Q9F7 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc146E9Q9F7 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc146E9Q9F7 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc146E9Q9F7 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc146E9Q9F7 Foxj3-202ENSMUST00000106310 4660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc146E9Q9F7 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc146E9Q9F7 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc146E9Q9F7 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc146E9Q9F7 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc146E9Q9F7 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc146E9Q9F7 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc146E9Q9F7 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc146E9Q9F7 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc146E9Q9F7 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc146E9Q9F7 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc146E9Q9F7 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc146E9Q9F7 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc146E9Q9F7 Gm12846-201ENSMUST00000120431 1373 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc146E9Q9F7 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc146E9Q9F7 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc146E9Q9F7 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc146E9Q9F7 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc146E9Q9F7 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc146E9Q9F7 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc146E9Q9F7 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc146E9Q9F7 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc146E9Q9F7 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc146E9Q9F7 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc146E9Q9F7 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc146E9Q9F7 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc146E9Q9F7 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc146E9Q9F7 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc146E9Q9F7 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc146E9Q9F7 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc146E9Q9F7 Hrg-201ENSMUST00000023590 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc146E9Q9F7 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc146E9Q9F7 Serpinb12-202ENSMUST00000112724 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc146E9Q9F7 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc146E9Q9F7 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc146E9Q9F7 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc146E9Q9F7 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc146E9Q9F7 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc146E9Q9F7 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc146E9Q9F7 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ccdc146E9Q9F7 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccdc146E9Q9F7 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms