Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6B2

Ccdc85c, Coiled-coil domain-containing protein 85C, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85cE9Q6B2 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Tbata-203ENSMUST00000121297 1000 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Smim20-201ENSMUST00000147148 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Gm42511-201ENSMUST00000196160 234 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 9430078K24Rik-203ENSMUST00000220293 638 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Tmbim7-204ENSMUST00000198739 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 9430078K24Rik-201ENSMUST00000218818 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Gpr137b-ps-202ENSMUST00000220647 1159 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 AC129308.3-201ENSMUST00000225652 524 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccdc85cE9Q6B2 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc85cE9Q6B2 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc85cE9Q6B2 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc85cE9Q6B2 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc85cE9Q6B2 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc85cE9Q6B2 Gm15003-201ENSMUST00000118884 446 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc85cE9Q6B2 Gm14034-201ENSMUST00000120147 551 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc85cE9Q6B2 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc85cE9Q6B2 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc85cE9Q6B2 Gm13572-201ENSMUST00000153675 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc85cE9Q6B2 Gm13965-201ENSMUST00000154834 576 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc85cE9Q6B2 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc85cE9Q6B2 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc85cE9Q6B2 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc85cE9Q6B2 Fkbp6-204ENSMUST00000201791 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc85cE9Q6B2 Gm40879-201ENSMUST00000220759 612 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc85cE9Q6B2 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc85cE9Q6B2 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc85cE9Q6B2 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc85cE9Q6B2 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc85cE9Q6B2 Chac2-202ENSMUST00000101394 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc85cE9Q6B2 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc85cE9Q6B2 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc85cE9Q6B2 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc85cE9Q6B2 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc85cE9Q6B2 Pi4kb-201ENSMUST00000072287 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc85cE9Q6B2 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc85cE9Q6B2 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc85cE9Q6B2 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc85cE9Q6B2 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc85cE9Q6B2 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc85cE9Q6B2 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms