Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 2310074N15Rik-201ENSMUST00000198276 582 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 4930405N21Rik-201ENSMUST00000199950 1200 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 Gm19091-201ENSMUST00000208120 978 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 AC126257.1-201ENSMUST00000213195 1536 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 Rabgef1-203ENSMUST00000119797 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 Gm19009-201ENSMUST00000223072 823 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 Hrct1-201ENSMUST00000095109 1452 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 Prss36-208ENSMUST00000156152 1132 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 Gm3619-201ENSMUST00000219947 775 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 CT025553.1-201ENSMUST00000226292 299 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 Gm5537-201ENSMUST00000091117 1252 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 Gm3551-201ENSMUST00000190750 664 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 Gm11149-203ENSMUST00000215465 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 Fbxo39-201ENSMUST00000108504 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 Lhcgr-201ENSMUST00000024916 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 A430108G06Rik-201ENSMUST00000153461 1428 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Trappc8E9PWG2 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms