Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Zscan22-201ENSMUST00000055528 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 C3-201ENSMUST00000024988 5136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Phf11cB4XVP9 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.1 ms