Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Pbld2-201ENSMUST00000020262 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Egfl7-201ENSMUST00000100290 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Dnajb1-202ENSMUST00000212300 2854 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Ptprk-202ENSMUST00000218276 4754 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Cfap77-204ENSMUST00000189711 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Eef1d-203ENSMUST00000089680 973 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Gm29585-203ENSMUST00000188089 835 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Gm2453-202ENSMUST00000195508 568 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Crabp2-201ENSMUST00000005019 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Usf3B2RUQ2 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms