Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Rhobtb1-205ENSMUST00000164034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Smpd4-206ENSMUST00000163997 1722 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Ndufa3-201ENSMUST00000076657 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Wdr18-201ENSMUST00000045247 3911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Gm3550W4VSN7 Art3-206ENSMUST00000120416 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
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