Protein–RNA interactions for Protein: V9GX34

Csmd2, CUB and Sushi multiple domains 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd2V9GX34 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Gm12179-201ENSMUST00000118344 1272 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 AA672651-201ENSMUST00000151550 489 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 C230057A21Rik-202ENSMUST00000195781 600 ntTSL 3 BASIC10□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 1700017M07Rik-201ENSMUST00000198307 940 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Defa-ps17-201ENSMUST00000121849 171 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Rpl41-201ENSMUST00000176010 582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Rpl41-204ENSMUST00000176906 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 AC105408.1-201ENSMUST00000227771 802 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Gm8181-201ENSMUST00000062242 669 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Prok2-201ENSMUST00000008273 594 ntTSL 3 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Meikin-201ENSMUST00000094193 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 AC154671.1-201ENSMUST00000228617 1578 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Gm14255-201ENSMUST00000128846 248 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Gm22442-201ENSMUST00000157256 144 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Gm42430-201ENSMUST00000197209 616 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Gm29763-201ENSMUST00000205306 616 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Gm45682-201ENSMUST00000209434 1256 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Gm12461-201ENSMUST00000120231 1239 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Fam187b-203ENSMUST00000129773 1213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Gm17944-201ENSMUST00000186351 643 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 1700086D15Rik-201ENSMUST00000020855 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Zdhhc21-202ENSMUST00000107239 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Oprl1-204ENSMUST00000108767 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Gm20735-202ENSMUST00000212387 519 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Uqcc3-201ENSMUST00000096253 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Mest-202ENSMUST00000124665 2665 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Gm11783-201ENSMUST00000119549 885 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 AC154361.2-201ENSMUST00000224747 943 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Mustn1-201ENSMUST00000040715 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Elob-201ENSMUST00000069579 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Naa10-202ENSMUST00000096316 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Csmd2V9GX34 Traf3ip3-212ENSMUST00000192020 1854 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms