Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

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Length 442 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Crlf3Q9Z2L7 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Crlf3Q9Z2L7 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Crlf3Q9Z2L7 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Crlf3Q9Z2L7 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Crlf3Q9Z2L7 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Crlf3Q9Z2L7 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Crlf3Q9Z2L7 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Crlf3Q9Z2L7 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Crlf3Q9Z2L7 Sufu-201ENSMUST00000039922 4522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Crlf3Q9Z2L7 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Crlf3Q9Z2L7 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Crlf3Q9Z2L7 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Crlf3Q9Z2L7 Fam78a-201ENSMUST00000056406 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Crlf3Q9Z2L7 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Crlf3Q9Z2L7 Pla2g15-204ENSMUST00000212963 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Crlf3Q9Z2L7 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Crlf3Q9Z2L7 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Crlf3Q9Z2L7 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Crlf3Q9Z2L7 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Crlf3Q9Z2L7 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Crlf3Q9Z2L7 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Crlf3Q9Z2L7 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Crlf3Q9Z2L7 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Crlf3Q9Z2L7 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Crlf3Q9Z2L7 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Crlf3Q9Z2L7 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Crlf3Q9Z2L7 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Crlf3Q9Z2L7 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Crlf3Q9Z2L7 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Crlf3Q9Z2L7 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Crlf3Q9Z2L7 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Crlf3Q9Z2L7 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Crlf3Q9Z2L7 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Crlf3Q9Z2L7 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Crlf3Q9Z2L7 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Crlf3Q9Z2L7 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Crlf3Q9Z2L7 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Crlf3Q9Z2L7 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Crlf3Q9Z2L7 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Crlf3Q9Z2L7 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Crlf3Q9Z2L7 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Crlf3Q9Z2L7 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Crlf3Q9Z2L7 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Crlf3Q9Z2L7 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Crlf3Q9Z2L7 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Crlf3Q9Z2L7 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Crlf3Q9Z2L7 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Crlf3Q9Z2L7 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Crlf3Q9Z2L7 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Crlf3Q9Z2L7 AU022754-201ENSMUST00000180441 2976 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Crlf3Q9Z2L7 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Crlf3Q9Z2L7 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Crlf3Q9Z2L7 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Crlf3Q9Z2L7 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Crlf3Q9Z2L7 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Crlf3Q9Z2L7 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Crlf3Q9Z2L7 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Crlf3Q9Z2L7 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Crlf3Q9Z2L7 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Crlf3Q9Z2L7 Atp1b2-201ENSMUST00000047889 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Crlf3Q9Z2L7 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Crlf3Q9Z2L7 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Crlf3Q9Z2L7 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Crlf3Q9Z2L7 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Crlf3Q9Z2L7 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Crlf3Q9Z2L7 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Crlf3Q9Z2L7 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Crlf3Q9Z2L7 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Crlf3Q9Z2L7 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Crlf3Q9Z2L7 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Crlf3Q9Z2L7 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Crlf3Q9Z2L7 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Crlf3Q9Z2L7 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Crlf3Q9Z2L7 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Crlf3Q9Z2L7 Gm45833-201ENSMUST00000211931 2730 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Crlf3Q9Z2L7 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Crlf3Q9Z2L7 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Crlf3Q9Z2L7 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Crlf3Q9Z2L7 Dmbt1-201ENSMUST00000084509 6243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Crlf3Q9Z2L7 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Crlf3Q9Z2L7 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Crlf3Q9Z2L7 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Crlf3Q9Z2L7 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Crlf3Q9Z2L7 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Crlf3Q9Z2L7 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Crlf3Q9Z2L7 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Crlf3Q9Z2L7 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Crlf3Q9Z2L7 Plcb2-206ENSMUST00000159756 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Crlf3Q9Z2L7 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Crlf3Q9Z2L7 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Crlf3Q9Z2L7 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Crlf3Q9Z2L7 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Crlf3Q9Z2L7 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Crlf3Q9Z2L7 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Crlf3Q9Z2L7 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Crlf3Q9Z2L7 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Crlf3Q9Z2L7 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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