Protein–RNA interactions for Protein: Q9QW08

Pdc, Phosducin, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdcQ9QW08 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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PdcQ9QW08 Dcaf1-202ENSMUST00000159645 4945 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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PdcQ9QW08 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Mir339-201ENSMUST00000083659 96 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
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PdcQ9QW08 Ap5b1-201ENSMUST00000096318 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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PdcQ9QW08 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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PdcQ9QW08 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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PdcQ9QW08 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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PdcQ9QW08 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Wnt3-201ENSMUST00000000127 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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PdcQ9QW08 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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PdcQ9QW08 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Mir1894-201ENSMUST00000122802 81 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
PdcQ9QW08 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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