Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Gm6506-201ENSMUST00000119775 1136 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Gm17334-201ENSMUST00000170390 907 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Gm28778-201ENSMUST00000190734 785 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Olfr1347-205ENSMUST00000220413 964 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Olfr1347-201ENSMUST00000036357 964 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Gm42791-202ENSMUST00000147473 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Smim5-203ENSMUST00000152171 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Gm45799-208ENSMUST00000211054 490 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 2900097C17Rik-202ENSMUST00000192863 4915 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Gde1Q9JL56 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms