Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKB3

Ybx3, Y-box-binding protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ybx3Q9JKB3 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Gm12712-201ENSMUST00000120676 801 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Gm13166-201ENSMUST00000123828 940 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Gm14222-201ENSMUST00000128681 575 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Apobr-203ENSMUST00000137646 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Gm13236-201ENSMUST00000153010 940 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 AC154826.1-201ENSMUST00000217369 498 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Acot13-201ENSMUST00000006900 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Cd55b-202ENSMUST00000119432 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 A430027H14Rik-202ENSMUST00000192797 618 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Gm42511-201ENSMUST00000196160 234 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Olfr692-202ENSMUST00000217827 1126 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 AC156568.1-201ENSMUST00000223018 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Olfr692-201ENSMUST00000098152 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Rpl7a-201ENSMUST00000102898 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Ndufc2-202ENSMUST00000149122 470 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Gm13965-201ENSMUST00000154834 576 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Fxyd5-203ENSMUST00000159924 805 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Fxyd5-210ENSMUST00000162116 817 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 4732414G09Rik-202ENSMUST00000180695 408 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Nmbr-206ENSMUST00000190114 662 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Gm5700-201ENSMUST00000191483 989 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 1700016D08Rik-202ENSMUST00000195807 368 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 BC106175-202ENSMUST00000219344 1213 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Gm6170-201ENSMUST00000187672 1388 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Pttg1-203ENSMUST00000101340 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Smim8-204ENSMUST00000108133 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Pttg1-205ENSMUST00000118368 696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Gm14213-201ENSMUST00000119778 768 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Utp23-202ENSMUST00000136129 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Clec7a-202ENSMUST00000184581 707 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ybx3Q9JKB3 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms