Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQR3

Kcnn1, Small conductance calcium-activated potassium channel protein 1, mousemouse

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Length 537 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnn1Q9EQR3 Gm11893-201ENSMUST00000117829 491 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnn1Q9EQR3 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnn1Q9EQR3 Gm12327-201ENSMUST00000121729 1168 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnn1Q9EQR3 Gm13010-201ENSMUST00000140495 828 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnn1Q9EQR3 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnn1Q9EQR3 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnn1Q9EQR3 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnn1Q9EQR3 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnn1Q9EQR3 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnn1Q9EQR3 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnn1Q9EQR3 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnn1Q9EQR3 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnn1Q9EQR3 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnn1Q9EQR3 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnn1Q9EQR3 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnn1Q9EQR3 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnn1Q9EQR3 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnn1Q9EQR3 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnn1Q9EQR3 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnn1Q9EQR3 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnn1Q9EQR3 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnn1Q9EQR3 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnn1Q9EQR3 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnn1Q9EQR3 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnn1Q9EQR3 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnn1Q9EQR3 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnn1Q9EQR3 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnn1Q9EQR3 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Kcnn1Q9EQR3 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnn1Q9EQR3 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnn1Q9EQR3 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnn1Q9EQR3 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnn1Q9EQR3 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnn1Q9EQR3 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnn1Q9EQR3 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnn1Q9EQR3 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnn1Q9EQR3 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnn1Q9EQR3 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnn1Q9EQR3 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnn1Q9EQR3 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnn1Q9EQR3 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnn1Q9EQR3 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnn1Q9EQR3 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnn1Q9EQR3 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnn1Q9EQR3 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Kcnn1Q9EQR3 Sec61g-202ENSMUST00000109642 691 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnn1Q9EQR3 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
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Kcnn1Q9EQR3 Gm14040-201ENSMUST00000139058 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnn1Q9EQR3 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Kcnn1Q9EQR3 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Kcnn1Q9EQR3 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Kcnn1Q9EQR3 Olfr725-201ENSMUST00000089844 1110 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnn1Q9EQR3 Gm5800-201ENSMUST00000095916 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Kcnn1Q9EQR3 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnn1Q9EQR3 Cpxcr1-201ENSMUST00000101269 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnn1Q9EQR3 Fbxo44-208ENSMUST00000167160 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Kcnn1Q9EQR3 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnn1Q9EQR3 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnn1Q9EQR3 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Kcnn1Q9EQR3 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Kcnn1Q9EQR3 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Kcnn1Q9EQR3 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Kcnn1Q9EQR3 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Kcnn1Q9EQR3 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Kcnn1Q9EQR3 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Kcnn1Q9EQR3 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnn1Q9EQR3 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnn1Q9EQR3 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnn1Q9EQR3 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnn1Q9EQR3 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnn1Q9EQR3 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnn1Q9EQR3 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnn1Q9EQR3 Gm14726-201ENSMUST00000120623 896 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnn1Q9EQR3 Gm13499-201ENSMUST00000142804 603 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnn1Q9EQR3 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnn1Q9EQR3 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnn1Q9EQR3 Gm42800-201ENSMUST00000202494 733 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnn1Q9EQR3 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnn1Q9EQR3 AC116465.1-201ENSMUST00000220324 235 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnn1Q9EQR3 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnn1Q9EQR3 Fsip1-201ENSMUST00000028820 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnn1Q9EQR3 Snapc5-201ENSMUST00000034965 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnn1Q9EQR3 Cxcl2-201ENSMUST00000075433 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnn1Q9EQR3 1700084M14Rik-201ENSMUST00000078832 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Kcnn1Q9EQR3 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms