Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

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Length 737 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 Trhr2-201ENSMUST00000044123 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 4930404N11Rik-201ENSMUST00000020456 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Syde1Q9DBZ9 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Syde1Q9DBZ9 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Syde1Q9DBZ9 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Syde1Q9DBZ9 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Syde1Q9DBZ9 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
Syde1Q9DBZ9 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Syde1Q9DBZ9 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Syde1Q9DBZ9 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Syde1Q9DBZ9 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Syde1Q9DBZ9 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Syde1Q9DBZ9 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Syde1Q9DBZ9 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Syde1Q9DBZ9 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Syde1Q9DBZ9 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Syde1Q9DBZ9 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Syde1Q9DBZ9 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Syde1Q9DBZ9 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Syde1Q9DBZ9 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Syde1Q9DBZ9 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Syde1Q9DBZ9 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Syde1Q9DBZ9 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Syde1Q9DBZ9 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Syde1Q9DBZ9 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Syde1Q9DBZ9 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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Syde1Q9DBZ9 Krtap5-1-201ENSMUST00000084413 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Syde1Q9DBZ9 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Syde1Q9DBZ9 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Syde1Q9DBZ9 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Syde1Q9DBZ9 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Syde1Q9DBZ9 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Syde1Q9DBZ9 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Syde1Q9DBZ9 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Syde1Q9DBZ9 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Syde1Q9DBZ9 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Syde1Q9DBZ9 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Syde1Q9DBZ9 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Syde1Q9DBZ9 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Syde1Q9DBZ9 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Syde1Q9DBZ9 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Syde1Q9DBZ9 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Syde1Q9DBZ9 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Syde1Q9DBZ9 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Syde1Q9DBZ9 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Syde1Q9DBZ9 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Syde1Q9DBZ9 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Syde1Q9DBZ9 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Syde1Q9DBZ9 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Syde1Q9DBZ9 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Syde1Q9DBZ9 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Syde1Q9DBZ9 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Syde1Q9DBZ9 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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