Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U3

Erp27, Endoplasmic reticulum resident protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erp27Q9D8U3 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Erp27Q9D8U3 Rbm8a-206ENSMUST00000200647 2620 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Erp27Q9D8U3 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Erp27Q9D8U3 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Erp27Q9D8U3 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Erp27Q9D8U3 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Erp27Q9D8U3 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Erp27Q9D8U3 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Erp27Q9D8U3 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Erp27Q9D8U3 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Erp27Q9D8U3 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Erp27Q9D8U3 Trim26-205ENSMUST00000130367 3187 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Erp27Q9D8U3 Dnmbp-201ENSMUST00000026209 4882 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Erp27Q9D8U3 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Erp27Q9D8U3 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Erp27Q9D8U3 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Erp27Q9D8U3 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Erp27Q9D8U3 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Erp27Q9D8U3 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Erp27Q9D8U3 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Erp27Q9D8U3 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Erp27Q9D8U3 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Erp27Q9D8U3 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Erp27Q9D8U3 Fam214b-205ENSMUST00000107959 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Erp27Q9D8U3 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Erp27Q9D8U3 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Erp27Q9D8U3 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Erp27Q9D8U3 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Erp27Q9D8U3 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Erp27Q9D8U3 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Erp27Q9D8U3 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Erp27Q9D8U3 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Erp27Q9D8U3 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Erp27Q9D8U3 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Erp27Q9D8U3 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Erp27Q9D8U3 Gm5896-201ENSMUST00000189662 1024 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Erp27Q9D8U3 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Erp27Q9D8U3 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Erp27Q9D8U3 Gm4768-201ENSMUST00000206199 686 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Erp27Q9D8U3 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Erp27Q9D8U3 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Erp27Q9D8U3 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Erp27Q9D8U3 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Erp27Q9D8U3 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Erp27Q9D8U3 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Erp27Q9D8U3 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Erp27Q9D8U3 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Erp27Q9D8U3 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Erp27Q9D8U3 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Erp27Q9D8U3 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Erp27Q9D8U3 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Erp27Q9D8U3 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Erp27Q9D8U3 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Erp27Q9D8U3 Gja8-201ENSMUST00000062944 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Erp27Q9D8U3 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Erp27Q9D8U3 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Erp27Q9D8U3 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Erp27Q9D8U3 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
Erp27Q9D8U3 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC11.9□□□□□ -0.51
Erp27Q9D8U3 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Erp27Q9D8U3 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Erp27Q9D8U3 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Erp27Q9D8U3 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Erp27Q9D8U3 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Erp27Q9D8U3 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Erp27Q9D8U3 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Erp27Q9D8U3 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Erp27Q9D8U3 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Erp27Q9D8U3 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Erp27Q9D8U3 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Erp27Q9D8U3 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Erp27Q9D8U3 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Erp27Q9D8U3 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Erp27Q9D8U3 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Erp27Q9D8U3 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Erp27Q9D8U3 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Erp27Q9D8U3 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Erp27Q9D8U3 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Erp27Q9D8U3 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Erp27Q9D8U3 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Erp27Q9D8U3 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Erp27Q9D8U3 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Erp27Q9D8U3 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Erp27Q9D8U3 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Erp27Q9D8U3 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Erp27Q9D8U3 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Erp27Q9D8U3 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Erp27Q9D8U3 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Erp27Q9D8U3 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Erp27Q9D8U3 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Erp27Q9D8U3 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Erp27Q9D8U3 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Erp27Q9D8U3 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Erp27Q9D8U3 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Erp27Q9D8U3 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Erp27Q9D8U3 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Erp27Q9D8U3 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Erp27Q9D8U3 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Erp27Q9D8U3 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Erp27Q9D8U3 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms