Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F1

Alkbh4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh4Q9D8F1 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Alkbh4Q9D8F1 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Gm37827-201ENSMUST00000194486 1542 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 1810043G02Rik-202ENSMUST00000105398 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Gm14966-202ENSMUST00000129675 649 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Vwf-202ENSMUST00000112253 2184 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Gm36266-201ENSMUST00000196660 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Spock3-201ENSMUST00000093480 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Gm12291-201ENSMUST00000121627 311 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Gm13165-201ENSMUST00000152923 383 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Erdr1-201ENSMUST00000177591 774 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Fabp4-201ENSMUST00000029041 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Clpb-201ENSMUST00000001884 4627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Alkbh4Q9D8F1 Spred3-201ENSMUST00000048923 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms