Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7T1

Rep15, Rab15 effector protein, mousemouse

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Length 230 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rep15Q9D7T1 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 4931428F04Rik-201ENSMUST00000014981 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Olfr222-203ENSMUST00000215339 2166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Slc17a5-202ENSMUST00000117645 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Wapl-202ENSMUST00000090027 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Ppil2-203ENSMUST00000115721 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Rsad1-201ENSMUST00000040487 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Gm26543-201ENSMUST00000180729 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Zfp526-201ENSMUST00000055604 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Zfp809-206ENSMUST00000215902 1800 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Arhgap24-206ENSMUST00000112854 2991 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Rep15Q9D7T1 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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