Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7E4

UPF0449 protein C19orf25 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D7E4 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Mapkbp1-201ENSMUST00000066058 6942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Bub1-201ENSMUST00000028858 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Q9D7E4 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Myh1-202ENSMUST00000075734 6012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Ankrd11-202ENSMUST00000098334 8455 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Klhl14-202ENSMUST00000122333 4423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Q9D7E4 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Ldhd-201ENSMUST00000070004 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Klhl3-201ENSMUST00000091583 6871 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Csf1-201ENSMUST00000014743 4176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Ppox-201ENSMUST00000073120 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Mroh7-201ENSMUST00000106770 4346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Mrgprd-201ENSMUST00000062163 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.85
Q9D7E4 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Q9D7E4 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Q9D7E4 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Q9D7E4 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Q9D7E4 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Q9D7E4 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Q9D7E4 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Q9D7E4 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Q9D7E4 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Q9D7E4 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Q9D7E4 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Q9D7E4 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Q9D7E4 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Q9D7E4 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Q9D7E4 Ptprg-201ENSMUST00000022264 9213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Q9D7E4 Fcgbp-203ENSMUST00000138392 7926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Q9D7E4 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Q9D7E4 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Q9D7E4 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Q9D7E4 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Q9D7E4 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Q9D7E4 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Q9D7E4 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Q9D7E4 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Q9D7E4 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Q9D7E4 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Q9D7E4 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Q9D7E4 Hspa9-201ENSMUST00000025217 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Q9D7E4 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Q9D7E4 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Q9D7E4 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Q9D7E4 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Q9D7E4 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Q9D7E4 Gm42943-201ENSMUST00000199676 3242 ntBASIC9.71□□□□□ -0.86
Q9D7E4 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
Q9D7E4 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.71□□□□□ -0.86
Q9D7E4 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q9D7E4 Prkch-201ENSMUST00000021527 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q9D7E4 Tcf4-238ENSMUST00000201631 2660 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q9D7E4 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q9D7E4 Tsku-201ENSMUST00000094161 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q9D7E4 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q9D7E4 Sec14l1-202ENSMUST00000090433 4654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q9D7E4 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q9D7E4 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q9D7E4 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q9D7E4 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q9D7E4 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q9D7E4 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q9D7E4 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q9D7E4 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q9D7E4 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q9D7E4 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q9D7E4 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q9D7E4 Gucy2e-203ENSMUST00000108665 3645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q9D7E4 Tal1-203ENSMUST00000161601 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q9D7E4 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q9D7E4 Wdr19-204ENSMUST00000203653 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q9D7E4 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q9D7E4 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q9D7E4 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q9D7E4 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Q9D7E4 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
Q9D7E4 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms