Protein–RNA interactions for Protein: Q9D662

Sec23b, Protein transport protein Sec23B, mousemouse

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23bQ9D662 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sec23bQ9D662 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sec23bQ9D662 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sec23bQ9D662 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Sec23bQ9D662 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec23bQ9D662 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec23bQ9D662 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec23bQ9D662 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec23bQ9D662 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec23bQ9D662 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec23bQ9D662 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec23bQ9D662 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec23bQ9D662 Pkib-203ENSMUST00000095668 3311 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec23bQ9D662 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec23bQ9D662 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec23bQ9D662 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec23bQ9D662 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec23bQ9D662 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec23bQ9D662 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec23bQ9D662 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec23bQ9D662 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec23bQ9D662 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec23bQ9D662 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec23bQ9D662 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec23bQ9D662 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec23bQ9D662 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec23bQ9D662 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec23bQ9D662 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec23bQ9D662 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec23bQ9D662 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec23bQ9D662 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec23bQ9D662 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec23bQ9D662 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec23bQ9D662 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec23bQ9D662 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec23bQ9D662 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec23bQ9D662 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec23bQ9D662 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec23bQ9D662 Bop1-201ENSMUST00000023217 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec23bQ9D662 C130026I21Rik-202ENSMUST00000093506 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec23bQ9D662 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec23bQ9D662 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec23bQ9D662 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec23bQ9D662 Rftn2-202ENSMUST00000114428 2012 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Sec23bQ9D662 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec23bQ9D662 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec23bQ9D662 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec23bQ9D662 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec23bQ9D662 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec23bQ9D662 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec23bQ9D662 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec23bQ9D662 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec23bQ9D662 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec23bQ9D662 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec23bQ9D662 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec23bQ9D662 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec23bQ9D662 AC166574.4-201ENSMUST00000227165 1937 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec23bQ9D662 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec23bQ9D662 Fen1-203ENSMUST00000142241 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec23bQ9D662 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec23bQ9D662 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec23bQ9D662 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec23bQ9D662 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec23bQ9D662 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec23bQ9D662 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec23bQ9D662 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec23bQ9D662 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec23bQ9D662 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec23bQ9D662 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec23bQ9D662 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec23bQ9D662 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec23bQ9D662 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec23bQ9D662 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec23bQ9D662 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec23bQ9D662 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec23bQ9D662 Rab11fip5-201ENSMUST00000060837 4035 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec23bQ9D662 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec23bQ9D662 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec23bQ9D662 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec23bQ9D662 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec23bQ9D662 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec23bQ9D662 Rsph3b-201ENSMUST00000024572 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec23bQ9D662 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec23bQ9D662 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec23bQ9D662 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec23bQ9D662 Rai1-203ENSMUST00000102688 6921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec23bQ9D662 Zc3h12d-201ENSMUST00000039484 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec23bQ9D662 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec23bQ9D662 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec23bQ9D662 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec23bQ9D662 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec23bQ9D662 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec23bQ9D662 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec23bQ9D662 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Sec23bQ9D662 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec23bQ9D662 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec23bQ9D662 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec23bQ9D662 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec23bQ9D662 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Sec23bQ9D662 Serpinh1-203ENSMUST00000207849 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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