Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrameQ9D4Z5 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrameQ9D4Z5 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrameQ9D4Z5 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrameQ9D4Z5 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrameQ9D4Z5 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrameQ9D4Z5 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrameQ9D4Z5 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrameQ9D4Z5 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrameQ9D4Z5 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrameQ9D4Z5 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrameQ9D4Z5 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrameQ9D4Z5 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrameQ9D4Z5 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrameQ9D4Z5 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrameQ9D4Z5 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrameQ9D4Z5 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrameQ9D4Z5 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrameQ9D4Z5 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
PrameQ9D4Z5 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PrameQ9D4Z5 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrameQ9D4Z5 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrameQ9D4Z5 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrameQ9D4Z5 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrameQ9D4Z5 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrameQ9D4Z5 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrameQ9D4Z5 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PrameQ9D4Z5 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrameQ9D4Z5 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrameQ9D4Z5 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrameQ9D4Z5 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrameQ9D4Z5 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrameQ9D4Z5 Gm25043-201ENSMUST00000158604 212 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PrameQ9D4Z5 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrameQ9D4Z5 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrameQ9D4Z5 Gm19891-201ENSMUST00000189771 303 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PrameQ9D4Z5 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PrameQ9D4Z5 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrameQ9D4Z5 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
PrameQ9D4Z5 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrameQ9D4Z5 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrameQ9D4Z5 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrameQ9D4Z5 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrameQ9D4Z5 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrameQ9D4Z5 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrameQ9D4Z5 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrameQ9D4Z5 Pak6-202ENSMUST00000110853 3677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrameQ9D4Z5 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrameQ9D4Z5 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrameQ9D4Z5 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrameQ9D4Z5 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrameQ9D4Z5 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrameQ9D4Z5 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrameQ9D4Z5 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrameQ9D4Z5 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PrameQ9D4Z5 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrameQ9D4Z5 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrameQ9D4Z5 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrameQ9D4Z5 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrameQ9D4Z5 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrameQ9D4Z5 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrameQ9D4Z5 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrameQ9D4Z5 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrameQ9D4Z5 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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PrameQ9D4Z5 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PrameQ9D4Z5 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrameQ9D4Z5 C1qtnf2-203ENSMUST00000173002 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrameQ9D4Z5 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrameQ9D4Z5 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PrameQ9D4Z5 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrameQ9D4Z5 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrameQ9D4Z5 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PrameQ9D4Z5 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrameQ9D4Z5 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrameQ9D4Z5 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrameQ9D4Z5 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrameQ9D4Z5 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrameQ9D4Z5 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrameQ9D4Z5 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrameQ9D4Z5 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrameQ9D4Z5 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrameQ9D4Z5 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrameQ9D4Z5 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrameQ9D4Z5 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PrameQ9D4Z5 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrameQ9D4Z5 5830411N06Rik-202ENSMUST00000093984 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrameQ9D4Z5 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrameQ9D4Z5 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PrameQ9D4Z5 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrameQ9D4Z5 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrameQ9D4Z5 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrameQ9D4Z5 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrameQ9D4Z5 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrameQ9D4Z5 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrameQ9D4Z5 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrameQ9D4Z5 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrameQ9D4Z5 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrameQ9D4Z5 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PrameQ9D4Z5 Pitx2-204ENSMUST00000172645 915 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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