Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

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Length 753 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lonrf3Q9D4H7 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lonrf3Q9D4H7 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lonrf3Q9D4H7 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lonrf3Q9D4H7 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lonrf3Q9D4H7 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lonrf3Q9D4H7 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lonrf3Q9D4H7 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lonrf3Q9D4H7 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Lonrf3Q9D4H7 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lonrf3Q9D4H7 Tnfrsf18-203ENSMUST00000122001 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lonrf3Q9D4H7 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lonrf3Q9D4H7 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lonrf3Q9D4H7 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lonrf3Q9D4H7 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Lonrf3Q9D4H7 Gm2420-203ENSMUST00000202748 447 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lonrf3Q9D4H7 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lonrf3Q9D4H7 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lonrf3Q9D4H7 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lonrf3Q9D4H7 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lonrf3Q9D4H7 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lonrf3Q9D4H7 Gm33543-203ENSMUST00000211096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lonrf3Q9D4H7 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lonrf3Q9D4H7 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lonrf3Q9D4H7 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lonrf3Q9D4H7 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lonrf3Q9D4H7 Cdkl2-204ENSMUST00000113143 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lonrf3Q9D4H7 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lonrf3Q9D4H7 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lonrf3Q9D4H7 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Lonrf3Q9D4H7 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lonrf3Q9D4H7 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lonrf3Q9D4H7 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lonrf3Q9D4H7 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lonrf3Q9D4H7 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lonrf3Q9D4H7 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lonrf3Q9D4H7 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lonrf3Q9D4H7 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lonrf3Q9D4H7 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lonrf3Q9D4H7 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lonrf3Q9D4H7 Uchl1os-201ENSMUST00000152002 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lonrf3Q9D4H7 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lonrf3Q9D4H7 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lonrf3Q9D4H7 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lonrf3Q9D4H7 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lonrf3Q9D4H7 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lonrf3Q9D4H7 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lonrf3Q9D4H7 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lonrf3Q9D4H7 Gm14286-201ENSMUST00000155674 464 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lonrf3Q9D4H7 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lonrf3Q9D4H7 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lonrf3Q9D4H7 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Lonrf3Q9D4H7 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lonrf3Q9D4H7 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lonrf3Q9D4H7 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lonrf3Q9D4H7 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lonrf3Q9D4H7 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lonrf3Q9D4H7 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lonrf3Q9D4H7 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lonrf3Q9D4H7 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lonrf3Q9D4H7 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lonrf3Q9D4H7 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lonrf3Q9D4H7 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lonrf3Q9D4H7 Gm6210-201ENSMUST00000204734 1942 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Lonrf3Q9D4H7 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lonrf3Q9D4H7 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lonrf3Q9D4H7 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lonrf3Q9D4H7 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lonrf3Q9D4H7 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lonrf3Q9D4H7 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lonrf3Q9D4H7 Hnf1b-202ENSMUST00000108113 2376 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lonrf3Q9D4H7 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lonrf3Q9D4H7 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lonrf3Q9D4H7 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lonrf3Q9D4H7 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lonrf3Q9D4H7 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Timm10b-208ENSMUST00000151193 1083 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lonrf3Q9D4H7 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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