Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYW4

Hdhd3, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdhd3Q9CYW4 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hdhd3Q9CYW4 Cdh7-202ENSMUST00000112701 4945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hdhd3Q9CYW4 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hdhd3Q9CYW4 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hdhd3Q9CYW4 D11Bhm181e-201ENSMUST00000122252 282 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Hdhd3Q9CYW4 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hdhd3Q9CYW4 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hdhd3Q9CYW4 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Hdhd3Q9CYW4 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hdhd3Q9CYW4 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Hdhd3Q9CYW4 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hdhd3Q9CYW4 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hdhd3Q9CYW4 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hdhd3Q9CYW4 AC192088.1-201ENSMUST00000227561 301 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Hdhd3Q9CYW4 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hdhd3Q9CYW4 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hdhd3Q9CYW4 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hdhd3Q9CYW4 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hdhd3Q9CYW4 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hdhd3Q9CYW4 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hdhd3Q9CYW4 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hdhd3Q9CYW4 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Hdhd3Q9CYW4 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hdhd3Q9CYW4 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hdhd3Q9CYW4 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hdhd3Q9CYW4 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hdhd3Q9CYW4 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hdhd3Q9CYW4 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hdhd3Q9CYW4 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Hdhd3Q9CYW4 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hdhd3Q9CYW4 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hdhd3Q9CYW4 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hdhd3Q9CYW4 Ufd1-201ENSMUST00000005394 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hdhd3Q9CYW4 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hdhd3Q9CYW4 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hdhd3Q9CYW4 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hdhd3Q9CYW4 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hdhd3Q9CYW4 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hdhd3Q9CYW4 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hdhd3Q9CYW4 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hdhd3Q9CYW4 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hdhd3Q9CYW4 Ednrb-203ENSMUST00000227824 2669 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hdhd3Q9CYW4 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hdhd3Q9CYW4 Olfr658-202ENSMUST00000210641 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hdhd3Q9CYW4 Olfr658-201ENSMUST00000089296 2912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hdhd3Q9CYW4 Gtf2ird1-207ENSMUST00000111245 3299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hdhd3Q9CYW4 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hdhd3Q9CYW4 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hdhd3Q9CYW4 Wbp1l-201ENSMUST00000099376 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hdhd3Q9CYW4 Rps6ka6-202ENSMUST00000082034 4170 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hdhd3Q9CYW4 Prdm1-201ENSMUST00000039174 5281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hdhd3Q9CYW4 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hdhd3Q9CYW4 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hdhd3Q9CYW4 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hdhd3Q9CYW4 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hdhd3Q9CYW4 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hdhd3Q9CYW4 Grin1-206ENSMUST00000114314 3882 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hdhd3Q9CYW4 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hdhd3Q9CYW4 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Hdhd3Q9CYW4 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hdhd3Q9CYW4 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hdhd3Q9CYW4 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Hdhd3Q9CYW4 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hdhd3Q9CYW4 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hdhd3Q9CYW4 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hdhd3Q9CYW4 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hdhd3Q9CYW4 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hdhd3Q9CYW4 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Hdhd3Q9CYW4 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hdhd3Q9CYW4 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hdhd3Q9CYW4 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hdhd3Q9CYW4 Rab14-201ENSMUST00000028238 3081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hdhd3Q9CYW4 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hdhd3Q9CYW4 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hdhd3Q9CYW4 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hdhd3Q9CYW4 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hdhd3Q9CYW4 Gnb1l-204ENSMUST00000115601 3507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hdhd3Q9CYW4 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hdhd3Q9CYW4 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hdhd3Q9CYW4 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hdhd3Q9CYW4 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Hdhd3Q9CYW4 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hdhd3Q9CYW4 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hdhd3Q9CYW4 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hdhd3Q9CYW4 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hdhd3Q9CYW4 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hdhd3Q9CYW4 Hnrnpf-201ENSMUST00000035493 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hdhd3Q9CYW4 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hdhd3Q9CYW4 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hdhd3Q9CYW4 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hdhd3Q9CYW4 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hdhd3Q9CYW4 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hdhd3Q9CYW4 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hdhd3Q9CYW4 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hdhd3Q9CYW4 Plin4-201ENSMUST00000002908 5755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hdhd3Q9CYW4 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hdhd3Q9CYW4 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hdhd3Q9CYW4 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hdhd3Q9CYW4 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Hdhd3Q9CYW4 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.7 ms