Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Gm45449-201ENSMUST00000211485 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Mettl27-201ENSMUST00000047196 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 CAAA01216754.1-201ENSMUST00000215882 1836 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 4930520O04Rik-202ENSMUST00000131898 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Scn10a-201ENSMUST00000084787 6416 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Agpat3-205ENSMUST00000105390 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Elp4-202ENSMUST00000122965 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Thsd4-202ENSMUST00000098660 8796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Sfmbt1-206ENSMUST00000228006 3299 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Ifi35-201ENSMUST00000010502 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC10.67□□□□□ -0.7
Rpusd4Q9CWX4 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC10.67□□□□□ -0.7
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