Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Rph3al-204ENSMUST00000121287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Gm16112-201ENSMUST00000159075 382 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Gm27017-201ENSMUST00000183031 656 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Vmn1r206-201ENSMUST00000187140 1135 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Gm8581-201ENSMUST00000188636 890 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Gm40332-201ENSMUST00000199847 938 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Gm35611-201ENSMUST00000205323 799 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 4930584E12Rik-201ENSMUST00000216646 981 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 AC153512.2-201ENSMUST00000220363 1273 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Il15ra-205ENSMUST00000114833 1607 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Fcf1Q9CTH6 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Gm14233-201ENSMUST00000149576 439 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Fcf1Q9CTH6 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Gm7895-201ENSMUST00000187459 1173 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Gm6312-201ENSMUST00000204060 1194 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Ssxb3-201ENSMUST00000089374 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Gm42479-201ENSMUST00000198654 1356 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Fcf1Q9CTH6 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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