Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ82

Itgb3bp, Centromere protein R, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3bpQ9CQ82 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Itgb3bpQ9CQ82 AC154639.1-201ENSMUST00000224393 2849 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Itgb3bpQ9CQ82 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Slc38a8-201ENSMUST00000036748 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Itgb3bpQ9CQ82 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Trpc2-201ENSMUST00000124189 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itgb3bpQ9CQ82 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Ecd-201ENSMUST00000022344 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Gm45253-201ENSMUST00000210694 2076 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Lvrn-201ENSMUST00000025358 3219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Cd19-204ENSMUST00000206325 2452 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Tas1r1-201ENSMUST00000030792 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itgb3bpQ9CQ82 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Timm22-201ENSMUST00000021203 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Zfp263-201ENSMUST00000023176 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Rai1-207ENSMUST00000171108 7125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Celrr-202ENSMUST00000181433 1561 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Ces5a-203ENSMUST00000212009 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Itgb3bpQ9CQ82 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Itgb3bpQ9CQ82 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Kcnt1-212ENSMUST00000197917 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Itgb3bpQ9CQ82 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Itgb3bpQ9CQ82 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms