Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV5

Bhlhe41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe41Q99PV5 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Gm28139-201ENSMUST00000189480 643 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Syngr2-201ENSMUST00000026649 1520 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Fosb-207ENSMUST00000208505 3523 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Map2k4-201ENSMUST00000046963 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Snora73a-201ENSMUST00000082453 205 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Zbtb7b-202ENSMUST00000107432 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Adcy9-201ENSMUST00000005719 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Snx14-207ENSMUST00000174806 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Lnx1-201ENSMUST00000039744 2727 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Coro2b-201ENSMUST00000048043 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Tsku-203ENSMUST00000165257 2514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Bhlhe41Q99PV5 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms