Protein–RNA interactions for Protein: Q99N89

Mrpl43, 39S ribosomal protein L43, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl43Q99N89 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Epb41l5-208ENSMUST00000191046 6870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Tle1-201ENSMUST00000030095 2569 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Otop1-202ENSMUST00000114099 3141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Psap-201ENSMUST00000004316 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Kdm4d-201ENSMUST00000058796 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Mrpl2-203ENSMUST00000113430 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Mpv17l-201ENSMUST00000023360 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Arntl-206ENSMUST00000211770 2464 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mrpl43Q99N89 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms