Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Lynx1-201ENSMUST00000023259 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Actr8-204ENSMUST00000224797 2328 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Atp1b4Q99ME6 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Lyzl6-202ENSMUST00000107014 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Anp32a-205ENSMUST00000135395 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 AC125486.1-201ENSMUST00000218701 320 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Bbs4-201ENSMUST00000026265 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Zscan10-203ENSMUST00000117606 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 AC160052.1-201ENSMUST00000213173 1248 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Atp1b4Q99ME6 AC159308.2-201ENSMUST00000213592 2325 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms