Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Cox7a2-201ENSMUST00000034881 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Pbld1-202ENSMUST00000178684 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC11.33□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Kif26b-201ENSMUST00000160789 6216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Gdpd3Q99LY2 Adi1-201ENSMUST00000020957 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Dnmt3l-201ENSMUST00000000746 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Gm12940-202ENSMUST00000137236 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Pcdhgb2-202ENSMUST00000195112 4661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Hk2-201ENSMUST00000000642 5513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Phlda2-201ENSMUST00000010904 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Gdpd3Q99LY2 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms