Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Ago1-201ENSMUST00000097888 7227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Sgsm1-203ENSMUST00000112324 1102 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Foxb1-201ENSMUST00000071281 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Xrra1-202ENSMUST00000207855 1334 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 AC169036.1-201ENSMUST00000227994 296 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Ripk3-201ENSMUST00000022830 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Usp16Q99LG0 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms