Protein–RNA interactions for Protein: Q99J83

Atg5, Autophagy protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg5Q99J83 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg5Q99J83 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg5Q99J83 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg5Q99J83 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg5Q99J83 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg5Q99J83 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg5Q99J83 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg5Q99J83 Mthfd1l-201ENSMUST00000043735 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg5Q99J83 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg5Q99J83 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg5Q99J83 Gm10545-201ENSMUST00000097612 4969 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg5Q99J83 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg5Q99J83 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg5Q99J83 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg5Q99J83 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg5Q99J83 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg5Q99J83 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg5Q99J83 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg5Q99J83 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg5Q99J83 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg5Q99J83 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg5Q99J83 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg5Q99J83 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg5Q99J83 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg5Q99J83 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg5Q99J83 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg5Q99J83 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg5Q99J83 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg5Q99J83 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg5Q99J83 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg5Q99J83 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg5Q99J83 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg5Q99J83 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg5Q99J83 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg5Q99J83 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg5Q99J83 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg5Q99J83 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg5Q99J83 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg5Q99J83 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg5Q99J83 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg5Q99J83 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg5Q99J83 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg5Q99J83 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg5Q99J83 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg5Q99J83 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg5Q99J83 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg5Q99J83 Zfp536-202ENSMUST00000175941 4423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg5Q99J83 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg5Q99J83 Clec16a-201ENSMUST00000038145 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg5Q99J83 Rcor3-201ENSMUST00000073279 3748 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg5Q99J83 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg5Q99J83 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg5Q99J83 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg5Q99J83 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg5Q99J83 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg5Q99J83 Fmo2-202ENSMUST00000111510 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg5Q99J83 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg5Q99J83 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg5Q99J83 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg5Q99J83 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg5Q99J83 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg5Q99J83 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg5Q99J83 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg5Q99J83 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg5Q99J83 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg5Q99J83 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg5Q99J83 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg5Q99J83 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg5Q99J83 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg5Q99J83 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg5Q99J83 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg5Q99J83 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg5Q99J83 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg5Q99J83 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg5Q99J83 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg5Q99J83 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg5Q99J83 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg5Q99J83 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg5Q99J83 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg5Q99J83 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg5Q99J83 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg5Q99J83 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg5Q99J83 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg5Q99J83 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg5Q99J83 Prkar1a-201ENSMUST00000049527 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg5Q99J83 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg5Q99J83 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg5Q99J83 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg5Q99J83 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg5Q99J83 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg5Q99J83 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg5Q99J83 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg5Q99J83 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg5Q99J83 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg5Q99J83 Gm42463-201ENSMUST00000198041 4886 ntBASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg5Q99J83 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg5Q99J83 Tmcc3-204ENSMUST00000121471 2614 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg5Q99J83 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg5Q99J83 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Atg5Q99J83 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms