Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Gm10451-201ENSMUST00000101281 1598 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Gm44702-201ENSMUST00000209194 592 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Gm6023-201ENSMUST00000118217 606 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Eif4e1b-204ENSMUST00000132005 706 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Gm9200-201ENSMUST00000118513 1354 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Nyap1-202ENSMUST00000118326 4565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Gm14123-201ENSMUST00000156345 2658 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
Ddb2Q99J79 Gm20404-201ENSMUST00000174032 621 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms