Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Ssc4d-201ENSMUST00000054895 1191 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC9.95□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.95□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Setx-201ENSMUST00000061578 10970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Gm8099-201ENSMUST00000200510 742 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Preb-201ENSMUST00000074840 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Rapgef2-206ENSMUST00000195708 6964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Hars2-201ENSMUST00000019287 2002 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Spata33-202ENSMUST00000212161 2941 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Srek1-201ENSMUST00000074616 3934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Ppargc1b-202ENSMUST00000075299 3656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Cldn16Q925N4 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
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