Protein–RNA interactions for Protein: Q91W40

Klc3, Kinesin light chain 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc3Q91W40 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Klc3Q91W40 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Klc3Q91W40 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Klc3Q91W40 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Klc3Q91W40 Gm40709-203ENSMUST00000219695 973 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klc3Q91W40 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klc3Q91W40 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klc3Q91W40 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klc3Q91W40 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klc3Q91W40 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klc3Q91W40 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Klc3Q91W40 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klc3Q91W40 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klc3Q91W40 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Klc3Q91W40 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klc3Q91W40 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klc3Q91W40 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klc3Q91W40 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klc3Q91W40 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klc3Q91W40 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Klc3Q91W40 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klc3Q91W40 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klc3Q91W40 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klc3Q91W40 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klc3Q91W40 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klc3Q91W40 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klc3Q91W40 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klc3Q91W40 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klc3Q91W40 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klc3Q91W40 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klc3Q91W40 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klc3Q91W40 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klc3Q91W40 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klc3Q91W40 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Klc3Q91W40 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Klc3Q91W40 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klc3Q91W40 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Klc3Q91W40 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klc3Q91W40 Gm28324-201ENSMUST00000187913 264 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Klc3Q91W40 Ighv1-48-201ENSMUST00000191795 294 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Klc3Q91W40 A630035G10Rik-202ENSMUST00000194468 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klc3Q91W40 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Klc3Q91W40 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klc3Q91W40 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klc3Q91W40 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klc3Q91W40 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klc3Q91W40 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klc3Q91W40 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klc3Q91W40 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klc3Q91W40 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klc3Q91W40 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klc3Q91W40 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klc3Q91W40 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klc3Q91W40 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klc3Q91W40 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klc3Q91W40 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klc3Q91W40 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klc3Q91W40 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klc3Q91W40 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klc3Q91W40 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Klc3Q91W40 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klc3Q91W40 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klc3Q91W40 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klc3Q91W40 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Klc3Q91W40 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klc3Q91W40 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klc3Q91W40 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klc3Q91W40 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klc3Q91W40 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Klc3Q91W40 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Klc3Q91W40 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klc3Q91W40 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klc3Q91W40 Rn7s6-201ENSMUST00000175005 291 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Klc3Q91W40 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klc3Q91W40 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klc3Q91W40 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klc3Q91W40 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klc3Q91W40 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klc3Q91W40 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klc3Q91W40 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klc3Q91W40 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Klc3Q91W40 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klc3Q91W40 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klc3Q91W40 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klc3Q91W40 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klc3Q91W40 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klc3Q91W40 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klc3Q91W40 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Klc3Q91W40 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Klc3Q91W40 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Klc3Q91W40 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Klc3Q91W40 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Klc3Q91W40 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klc3Q91W40 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klc3Q91W40 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klc3Q91W40 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klc3Q91W40 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klc3Q91W40 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Klc3Q91W40 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Klc3Q91W40 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms