Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trappc12Q8K2L8 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trappc12Q8K2L8 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trappc12Q8K2L8 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Trappc12Q8K2L8 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trappc12Q8K2L8 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trappc12Q8K2L8 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Trappc12Q8K2L8 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc12Q8K2L8 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc12Q8K2L8 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc12Q8K2L8 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc12Q8K2L8 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc12Q8K2L8 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc12Q8K2L8 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc12Q8K2L8 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc12Q8K2L8 AC132901.1-201ENSMUST00000224345 508 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc12Q8K2L8 Sat1-201ENSMUST00000026318 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc12Q8K2L8 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc12Q8K2L8 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc12Q8K2L8 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc12Q8K2L8 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc12Q8K2L8 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc12Q8K2L8 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc12Q8K2L8 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc12Q8K2L8 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc12Q8K2L8 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc12Q8K2L8 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc12Q8K2L8 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc12Q8K2L8 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc12Q8K2L8 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc12Q8K2L8 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc12Q8K2L8 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc12Q8K2L8 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Trappc12Q8K2L8 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc12Q8K2L8 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc12Q8K2L8 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc12Q8K2L8 Cd72-205ENSMUST00000107926 1419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc12Q8K2L8 Cd72-203ENSMUST00000098105 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc12Q8K2L8 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc12Q8K2L8 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc12Q8K2L8 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc12Q8K2L8 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc12Q8K2L8 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc12Q8K2L8 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc12Q8K2L8 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc12Q8K2L8 Gm9358-201ENSMUST00000183067 927 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc12Q8K2L8 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc12Q8K2L8 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc12Q8K2L8 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc12Q8K2L8 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc12Q8K2L8 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc12Q8K2L8 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc12Q8K2L8 Ifi27-205ENSMUST00000085065 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc12Q8K2L8 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc12Q8K2L8 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc12Q8K2L8 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc12Q8K2L8 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc12Q8K2L8 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc12Q8K2L8 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc12Q8K2L8 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc12Q8K2L8 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc12Q8K2L8 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc12Q8K2L8 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc12Q8K2L8 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc12Q8K2L8 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc12Q8K2L8 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Trappc12Q8K2L8 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc12Q8K2L8 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc12Q8K2L8 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc12Q8K2L8 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc12Q8K2L8 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc12Q8K2L8 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc12Q8K2L8 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc12Q8K2L8 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc12Q8K2L8 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc12Q8K2L8 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc12Q8K2L8 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc12Q8K2L8 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc12Q8K2L8 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc12Q8K2L8 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc12Q8K2L8 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc12Q8K2L8 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc12Q8K2L8 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc12Q8K2L8 Gm8199-201ENSMUST00000121323 823 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc12Q8K2L8 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc12Q8K2L8 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc12Q8K2L8 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc12Q8K2L8 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc12Q8K2L8 Coa3-202ENSMUST00000168089 291 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc12Q8K2L8 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc12Q8K2L8 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc12Q8K2L8 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc12Q8K2L8 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc12Q8K2L8 Gm35822-201ENSMUST00000204954 562 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc12Q8K2L8 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc12Q8K2L8 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc12Q8K2L8 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc12Q8K2L8 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc12Q8K2L8 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Trappc12Q8K2L8 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms