Protein–RNA interactions for Protein: Q8K119

Pms1, PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pms1Q8K119 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pms1Q8K119 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pms1Q8K119 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pms1Q8K119 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pms1Q8K119 Map4k1-203ENSMUST00000208227 2720 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pms1Q8K119 Map4k1-201ENSMUST00000085835 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pms1Q8K119 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pms1Q8K119 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pms1Q8K119 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pms1Q8K119 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pms1Q8K119 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pms1Q8K119 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pms1Q8K119 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pms1Q8K119 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pms1Q8K119 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pms1Q8K119 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pms1Q8K119 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pms1Q8K119 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pms1Q8K119 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pms1Q8K119 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pms1Q8K119 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pms1Q8K119 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pms1Q8K119 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Pms1Q8K119 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pms1Q8K119 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pms1Q8K119 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pms1Q8K119 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pms1Q8K119 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pms1Q8K119 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Pms1Q8K119 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pms1Q8K119 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Pms1Q8K119 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Pms1Q8K119 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pms1Q8K119 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pms1Q8K119 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pms1Q8K119 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pms1Q8K119 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pms1Q8K119 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pms1Q8K119 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pms1Q8K119 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pms1Q8K119 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pms1Q8K119 Mtm1-201ENSMUST00000025391 3286 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pms1Q8K119 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pms1Q8K119 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pms1Q8K119 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pms1Q8K119 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pms1Q8K119 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pms1Q8K119 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pms1Q8K119 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pms1Q8K119 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pms1Q8K119 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pms1Q8K119 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Pms1Q8K119 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pms1Q8K119 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pms1Q8K119 Nxph1-201ENSMUST00000060369 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pms1Q8K119 A730020E08Rik-201ENSMUST00000180421 3387 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pms1Q8K119 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Pms1Q8K119 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pms1Q8K119 Gm24548-201ENSMUST00000158650 108 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Pms1Q8K119 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pms1Q8K119 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pms1Q8K119 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Pms1Q8K119 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Pms1Q8K119 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pms1Q8K119 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Pms1Q8K119 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pms1Q8K119 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pms1Q8K119 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pms1Q8K119 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pms1Q8K119 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pms1Q8K119 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pms1Q8K119 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pms1Q8K119 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pms1Q8K119 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pms1Q8K119 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pms1Q8K119 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pms1Q8K119 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pms1Q8K119 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pms1Q8K119 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pms1Q8K119 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pms1Q8K119 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pms1Q8K119 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Pms1Q8K119 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pms1Q8K119 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pms1Q8K119 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pms1Q8K119 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pms1Q8K119 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pms1Q8K119 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pms1Q8K119 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pms1Q8K119 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pms1Q8K119 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Pms1Q8K119 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Pms1Q8K119 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pms1Q8K119 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pms1Q8K119 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pms1Q8K119 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Pms1Q8K119 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Pms1Q8K119 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pms1Q8K119 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Pms1Q8K119 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.2 ms