Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5T8

Ccdc113, Coiled-coil domain-containing protein 113, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc113Q8C5T8 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc113Q8C5T8 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc113Q8C5T8 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc113Q8C5T8 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc113Q8C5T8 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc113Q8C5T8 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc113Q8C5T8 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc113Q8C5T8 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Ccdc113Q8C5T8 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 Cox6b2-204ENSMUST00000182173 391 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 Mocs2-215ENSMUST00000184335 646 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 Samd4-202ENSMUST00000100672 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 Npepps-219ENSMUST00000172108 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 Dysf-210ENSMUST00000153860 6525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 Chodl-202ENSMUST00000069148 2051 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 Gm12058-201ENSMUST00000118614 437 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 Brsk1-205ENSMUST00000206024 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 Nr0b2-201ENSMUST00000042706 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 Cdv3-203ENSMUST00000116517 3741 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Ccdc113Q8C5T8 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.6 ms