Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
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Ube3dQ8BX13 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Ube3dQ8BX13 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Cmtm6-201ENSMUST00000035007 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Ube3dQ8BX13 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Ube3dQ8BX13 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Ube3dQ8BX13 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Ube3dQ8BX13 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Ube3dQ8BX13 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Acoxl-202ENSMUST00000110344 1573 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
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Ube3dQ8BX13 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Nbeal2-211ENSMUST00000196488 8599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Ube3dQ8BX13 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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