Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV57

Ssc5d, Soluble scavenger receptor cysteine-rich domain-containing protein SSC5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,371 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssc5dQ8BV57 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Sec11a-204ENSMUST00000120285 875 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Gm14247-201ENSMUST00000120950 237 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 3300002P13Rik-201ENSMUST00000204020 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Ssc5dQ8BV57 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Defb36-201ENSMUST00000058086 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Cldn17-201ENSMUST00000069549 1172 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Ssc5dQ8BV57 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Ndufs4-201ENSMUST00000022286 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Ssc5dQ8BV57 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Ssc5dQ8BV57 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Ssc5dQ8BV57 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Ssc5dQ8BV57 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Ssc5dQ8BV57 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Ssc5dQ8BV57 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Srsf5-202ENSMUST00000110351 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ssc5dQ8BV57 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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