Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

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Length 515 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Kdm1b-201ENSMUST00000037025 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Aph1a-201ENSMUST00000015894 2863 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Nat8f1-201ENSMUST00000161198 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43416-201ENSMUST00000201916 1015 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Sirt2-202ENSMUST00000122915 1828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Agpat5-202ENSMUST00000149565 10779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Ankzf1-208ENSMUST00000152233 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Ptpru-201ENSMUST00000030741 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Prss47-204ENSMUST00000222769 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Dtx1-201ENSMUST00000031607 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Htr2c-207ENSMUST00000156697 4654 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Eif2ak1-201ENSMUST00000100487 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 AC159195.1-201ENSMUST00000225867 2086 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Txndc2-201ENSMUST00000050236 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Slc39a9-208ENSMUST00000219706 5427 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 4930563D23Rik-201ENSMUST00000062638 2646 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Lrrtm2Q8BGA3 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms