Protein–RNA interactions for Protein: Q812A2

Srgap3, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,099 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srgap3Q812A2 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srgap3Q812A2 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srgap3Q812A2 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srgap3Q812A2 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srgap3Q812A2 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srgap3Q812A2 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Srgap3Q812A2 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srgap3Q812A2 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srgap3Q812A2 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srgap3Q812A2 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srgap3Q812A2 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srgap3Q812A2 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srgap3Q812A2 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srgap3Q812A2 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srgap3Q812A2 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srgap3Q812A2 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srgap3Q812A2 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srgap3Q812A2 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Srgap3Q812A2 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Srgap3Q812A2 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srgap3Q812A2 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srgap3Q812A2 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srgap3Q812A2 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Srgap3Q812A2 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srgap3Q812A2 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srgap3Q812A2 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srgap3Q812A2 Cluap1-201ENSMUST00000040881 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srgap3Q812A2 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srgap3Q812A2 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srgap3Q812A2 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srgap3Q812A2 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srgap3Q812A2 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srgap3Q812A2 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srgap3Q812A2 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srgap3Q812A2 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srgap3Q812A2 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srgap3Q812A2 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srgap3Q812A2 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srgap3Q812A2 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srgap3Q812A2 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srgap3Q812A2 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Srgap3Q812A2 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srgap3Q812A2 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srgap3Q812A2 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srgap3Q812A2 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Srgap3Q812A2 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srgap3Q812A2 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srgap3Q812A2 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srgap3Q812A2 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srgap3Q812A2 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srgap3Q812A2 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srgap3Q812A2 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srgap3Q812A2 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srgap3Q812A2 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srgap3Q812A2 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srgap3Q812A2 Gm14999-201ENSMUST00000121039 624 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Srgap3Q812A2 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Srgap3Q812A2 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srgap3Q812A2 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srgap3Q812A2 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Srgap3Q812A2 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srgap3Q812A2 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Srgap3Q812A2 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srgap3Q812A2 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Srgap3Q812A2 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srgap3Q812A2 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Srgap3Q812A2 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srgap3Q812A2 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srgap3Q812A2 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srgap3Q812A2 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srgap3Q812A2 Cd200r1-201ENSMUST00000057488 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srgap3Q812A2 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srgap3Q812A2 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Srgap3Q812A2 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srgap3Q812A2 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srgap3Q812A2 Mkl1-209ENSMUST00000149582 4366 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srgap3Q812A2 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srgap3Q812A2 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srgap3Q812A2 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srgap3Q812A2 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srgap3Q812A2 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srgap3Q812A2 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srgap3Q812A2 Rap1gds1-202ENSMUST00000098574 3669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srgap3Q812A2 Zfp433-202ENSMUST00000200889 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srgap3Q812A2 Gm32687-201ENSMUST00000220314 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Srgap3Q812A2 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Srgap3Q812A2 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srgap3Q812A2 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srgap3Q812A2 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srgap3Q812A2 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srgap3Q812A2 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srgap3Q812A2 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srgap3Q812A2 Cyp4f39-201ENSMUST00000003413 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srgap3Q812A2 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srgap3Q812A2 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Srgap3Q812A2 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srgap3Q812A2 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srgap3Q812A2 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Srgap3Q812A2 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Srgap3Q812A2 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95 ms