Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH7

Kcnf1, Potassium voltage-gated channel subfamily F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnf1Q7TSH7 Arid4a-201ENSMUST00000046305 4998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kcnf1Q7TSH7 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kcnf1Q7TSH7 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kcnf1Q7TSH7 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kcnf1Q7TSH7 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kcnf1Q7TSH7 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kcnf1Q7TSH7 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Kcnf1Q7TSH7 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kcnf1Q7TSH7 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kcnf1Q7TSH7 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kcnf1Q7TSH7 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Kcnf1Q7TSH7 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kcnf1Q7TSH7 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kcnf1Q7TSH7 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kcnf1Q7TSH7 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kcnf1Q7TSH7 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kcnf1Q7TSH7 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kcnf1Q7TSH7 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Kcnf1Q7TSH7 Helq-201ENSMUST00000044684 3689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kcnf1Q7TSH7 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kcnf1Q7TSH7 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kcnf1Q7TSH7 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kcnf1Q7TSH7 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Kcnf1Q7TSH7 Wsb2-202ENSMUST00000111959 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kcnf1Q7TSH7 Gm9361-201ENSMUST00000198695 1507 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Kcnf1Q7TSH7 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kcnf1Q7TSH7 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kcnf1Q7TSH7 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kcnf1Q7TSH7 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kcnf1Q7TSH7 Fam83h-201ENSMUST00000060807 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kcnf1Q7TSH7 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kcnf1Q7TSH7 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kcnf1Q7TSH7 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kcnf1Q7TSH7 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kcnf1Q7TSH7 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kcnf1Q7TSH7 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kcnf1Q7TSH7 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kcnf1Q7TSH7 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kcnf1Q7TSH7 Rbm5-201ENSMUST00000035199 3064 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kcnf1Q7TSH7 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kcnf1Q7TSH7 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kcnf1Q7TSH7 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Kcnf1Q7TSH7 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Kcnf1Q7TSH7 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kcnf1Q7TSH7 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kcnf1Q7TSH7 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kcnf1Q7TSH7 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kcnf1Q7TSH7 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kcnf1Q7TSH7 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kcnf1Q7TSH7 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kcnf1Q7TSH7 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kcnf1Q7TSH7 Pcp4l1-201ENSMUST00000111332 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kcnf1Q7TSH7 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kcnf1Q7TSH7 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kcnf1Q7TSH7 Cbx7-201ENSMUST00000089293 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kcnf1Q7TSH7 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kcnf1Q7TSH7 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kcnf1Q7TSH7 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kcnf1Q7TSH7 Slx4ip-206ENSMUST00000180277 2723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kcnf1Q7TSH7 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kcnf1Q7TSH7 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kcnf1Q7TSH7 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Kcnf1Q7TSH7 Slc45a2-201ENSMUST00000117100 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Kcnf1Q7TSH7 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Kcnf1Q7TSH7 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Kcnf1Q7TSH7 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Kcnf1Q7TSH7 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Kcnf1Q7TSH7 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Kcnf1Q7TSH7 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Kcnf1Q7TSH7 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Kcnf1Q7TSH7 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Kcnf1Q7TSH7 Lgals3bp-201ENSMUST00000043722 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Kcnf1Q7TSH7 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Kcnf1Q7TSH7 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Kcnf1Q7TSH7 Nanos2-201ENSMUST00000063563 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Kcnf1Q7TSH7 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Kcnf1Q7TSH7 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Kcnf1Q7TSH7 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Kcnf1Q7TSH7 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Kcnf1Q7TSH7 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Kcnf1Q7TSH7 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Kcnf1Q7TSH7 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Kcnf1Q7TSH7 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Kcnf1Q7TSH7 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Kcnf1Q7TSH7 Ppp1r16b-201ENSMUST00000045503 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Kcnf1Q7TSH7 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Kcnf1Q7TSH7 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Kcnf1Q7TSH7 Gm45187-201ENSMUST00000207697 2760 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Kcnf1Q7TSH7 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Kcnf1Q7TSH7 Mbnl2-208ENSMUST00000227594 2334 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Kcnf1Q7TSH7 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Kcnf1Q7TSH7 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Kcnf1Q7TSH7 Tmcc2-203ENSMUST00000132435 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Kcnf1Q7TSH7 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Kcnf1Q7TSH7 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Kcnf1Q7TSH7 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Kcnf1Q7TSH7 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Kcnf1Q7TSH7 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Kcnf1Q7TSH7 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Kcnf1Q7TSH7 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
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