Protein–RNA interactions for Protein: Q768S4

Rph3al, Rab effector Noc2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rph3alQ768S4 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Cit-212ENSMUST00000141101 6794 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Furin-201ENSMUST00000107362 4166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Rph3alQ768S4 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Gm11476-201ENSMUST00000127006 2019 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Rph3alQ768S4 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Rph3alQ768S4 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Rph3alQ768S4 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Dnajc14-207ENSMUST00000219508 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Olfm2-201ENSMUST00000034692 1836 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Mrgprg-201ENSMUST00000058092 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
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Rph3alQ768S4 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.8
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Rph3alQ768S4 Atat1-212ENSMUST00000141662 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
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Rph3alQ768S4 Mthfr-201ENSMUST00000069604 6072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
Rph3alQ768S4 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
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Rph3alQ768S4 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Rph3alQ768S4 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rph3alQ768S4 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rph3alQ768S4 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Rph3alQ768S4 Myh11-201ENSMUST00000090287 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rph3alQ768S4 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rph3alQ768S4 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rph3alQ768S4 Igtp-202ENSMUST00000094169 1767 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rph3alQ768S4 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rph3alQ768S4 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Rph3alQ768S4 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Rph3alQ768S4 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
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Rph3alQ768S4 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rph3alQ768S4 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rph3alQ768S4 Gm43666-201ENSMUST00000197116 2989 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rph3alQ768S4 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rph3alQ768S4 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rph3alQ768S4 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Rph3alQ768S4 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Rph3alQ768S4 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rph3alQ768S4 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rph3alQ768S4 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rph3alQ768S4 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
Rph3alQ768S4 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rph3alQ768S4 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rph3alQ768S4 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rph3alQ768S4 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rph3alQ768S4 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rph3alQ768S4 Hspa2-202ENSMUST00000219555 2526 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rph3alQ768S4 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rph3alQ768S4 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rph3alQ768S4 Whamm-203ENSMUST00000209044 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Rph3alQ768S4 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
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