Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ccdc88cQ6VGS5 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Ccdc88cQ6VGS5 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Ccdc88cQ6VGS5 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Ccdc88cQ6VGS5 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc88cQ6VGS5 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Cenpo-201ENSMUST00000020981 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Gm32479-201ENSMUST00000204226 2739 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37391-201ENSMUST00000194891 2318 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms