Protein–RNA interactions for Protein: Q6U7R4

Timd4, T-cell immunoglobulin and mucin domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timd4Q6U7R4 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Timd4Q6U7R4 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Timd4Q6U7R4 Gm5422-201ENSMUST00000050717 2721 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Timd4Q6U7R4 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Timd4Q6U7R4 Wdr25-202ENSMUST00000167816 2657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Timd4Q6U7R4 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Timd4Q6U7R4 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Timd4Q6U7R4 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Timd4Q6U7R4 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC11.7□□□□□ -0.54
Timd4Q6U7R4 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC11.7□□□□□ -0.54
Timd4Q6U7R4 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.7□□□□□ -0.54
Timd4Q6U7R4 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Timd4Q6U7R4 4933421I07Rik-201ENSMUST00000032648 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Timd4Q6U7R4 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Timd4Q6U7R4 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Timd4Q6U7R4 Sppl2a-201ENSMUST00000028844 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Timd4Q6U7R4 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Timd4Q6U7R4 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Timd4Q6U7R4 Cant1-206ENSMUST00000164927 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Timd4Q6U7R4 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Timd4Q6U7R4 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Timd4Q6U7R4 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Timd4Q6U7R4 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Timd4Q6U7R4 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Timd4Q6U7R4 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Timd4Q6U7R4 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Timd4Q6U7R4 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Timd4Q6U7R4 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Timd4Q6U7R4 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Timd4Q6U7R4 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Timd4Q6U7R4 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Timd4Q6U7R4 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Timd4Q6U7R4 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Timd4Q6U7R4 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Timd4Q6U7R4 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Timd4Q6U7R4 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Timd4Q6U7R4 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Timd4Q6U7R4 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Timd4Q6U7R4 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Timd4Q6U7R4 Cul9-201ENSMUST00000066026 7818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Timd4Q6U7R4 Brf2-201ENSMUST00000033877 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Timd4Q6U7R4 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Timd4Q6U7R4 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Timd4Q6U7R4 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Timd4Q6U7R4 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Timd4Q6U7R4 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Timd4Q6U7R4 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Timd4Q6U7R4 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Timd4Q6U7R4 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Timd4Q6U7R4 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Timd4Q6U7R4 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Timd4Q6U7R4 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Timd4Q6U7R4 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Timd4Q6U7R4 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Timd4Q6U7R4 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Timd4Q6U7R4 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Timd4Q6U7R4 Gm7789-202ENSMUST00000211273 1400 ntBASIC11.69□□□□□ -0.54
Timd4Q6U7R4 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Timd4Q6U7R4 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Timd4Q6U7R4 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Timd4Q6U7R4 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Timd4Q6U7R4 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Timd4Q6U7R4 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Timd4Q6U7R4 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Timd4Q6U7R4 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Timd4Q6U7R4 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Timd4Q6U7R4 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Timd4Q6U7R4 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Timd4Q6U7R4 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Timd4Q6U7R4 Gm12050-201ENSMUST00000127483 615 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Timd4Q6U7R4 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Timd4Q6U7R4 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Timd4Q6U7R4 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Timd4Q6U7R4 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Timd4Q6U7R4 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Timd4Q6U7R4 Gm43403-202ENSMUST00000198830 370 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Timd4Q6U7R4 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Timd4Q6U7R4 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Timd4Q6U7R4 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Timd4Q6U7R4 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Timd4Q6U7R4 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Timd4Q6U7R4 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Timd4Q6U7R4 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Timd4Q6U7R4 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Timd4Q6U7R4 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Timd4Q6U7R4 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Timd4Q6U7R4 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Timd4Q6U7R4 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Timd4Q6U7R4 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Timd4Q6U7R4 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Timd4Q6U7R4 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Timd4Q6U7R4 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Timd4Q6U7R4 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Timd4Q6U7R4 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Timd4Q6U7R4 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Timd4Q6U7R4 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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