Protein–RNA interactions for Protein: Q62066

Phox2a, Paired mesoderm homeobox protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phox2aQ62066 Gm28913-201ENSMUST00000186240 364 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Otub2-202ENSMUST00000101094 3228 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Nop14-201ENSMUST00000041364 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Tmem140-201ENSMUST00000074949 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Slc30a8-201ENSMUST00000037240 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Ank1-204ENSMUST00000117270 5652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Nsmce2-202ENSMUST00000168722 2679 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Ttc17-202ENSMUST00000094801 3408 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Myt1l-201ENSMUST00000021009 5027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 BC043934-202ENSMUST00000185694 2356 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Ralgps2-209ENSMUST00000189316 2924 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Glrx3-203ENSMUST00000211496 3440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Gm10686-201ENSMUST00000215389 3247 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Aplp2-209ENSMUST00000217641 3462 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Astl-201ENSMUST00000059839 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Phox2aQ62066 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
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