Protein–RNA interactions for Protein: Q61510

Trim25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim25Q61510 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Nxph2-201ENSMUST00000102945 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 3110062M04Rik-201ENSMUST00000055097 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Spock3-203ENSMUST00000118003 2860 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 1700095B10Rik-201ENSMUST00000182349 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Gm6458-201ENSMUST00000211573 635 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Chchd10-203ENSMUST00000219839 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 1110051M20Rik-203ENSMUST00000102594 1977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Tex9-209ENSMUST00000184125 2794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Phactr1-206ENSMUST00000131942 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Steap3-204ENSMUST00000112643 2873 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Trappc5-202ENSMUST00000207787 4411 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Nr5a2-202ENSMUST00000168126 3446 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Chrdl1-204ENSMUST00000166406 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Rragd-202ENSMUST00000084747 4295 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Cd72-201ENSMUST00000030179 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Cabp5-201ENSMUST00000005791 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trim25Q61510 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms