Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CttnQ60598 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CttnQ60598 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CttnQ60598 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CttnQ60598 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CttnQ60598 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CttnQ60598 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CttnQ60598 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CttnQ60598 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CttnQ60598 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CttnQ60598 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CttnQ60598 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CttnQ60598 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
CttnQ60598 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CttnQ60598 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CttnQ60598 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CttnQ60598 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CttnQ60598 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CttnQ60598 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CttnQ60598 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CttnQ60598 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CttnQ60598 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CttnQ60598 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CttnQ60598 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CttnQ60598 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CttnQ60598 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CttnQ60598 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CttnQ60598 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CttnQ60598 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CttnQ60598 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CttnQ60598 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CttnQ60598 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CttnQ60598 Pigp-205ENSMUST00000113917 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CttnQ60598 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CttnQ60598 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CttnQ60598 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CttnQ60598 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CttnQ60598 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CttnQ60598 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CttnQ60598 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CttnQ60598 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CttnQ60598 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CttnQ60598 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CttnQ60598 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CttnQ60598 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CttnQ60598 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
CttnQ60598 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CttnQ60598 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
CttnQ60598 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
CttnQ60598 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
CttnQ60598 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CttnQ60598 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CttnQ60598 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CttnQ60598 Arhgef40-202ENSMUST00000100639 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CttnQ60598 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CttnQ60598 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CttnQ60598 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CttnQ60598 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CttnQ60598 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CttnQ60598 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CttnQ60598 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CttnQ60598 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CttnQ60598 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CttnQ60598 Shank2-203ENSMUST00000105902 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CttnQ60598 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CttnQ60598 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CttnQ60598 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CttnQ60598 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CttnQ60598 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CttnQ60598 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CttnQ60598 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CttnQ60598 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CttnQ60598 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CttnQ60598 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CttnQ60598 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CttnQ60598 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CttnQ60598 Vmn1r217-201ENSMUST00000091721 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CttnQ60598 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CttnQ60598 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CttnQ60598 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CttnQ60598 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CttnQ60598 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CttnQ60598 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CttnQ60598 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CttnQ60598 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CttnQ60598 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CttnQ60598 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CttnQ60598 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CttnQ60598 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CttnQ60598 Dhx58os-201ENSMUST00000137154 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CttnQ60598 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CttnQ60598 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CttnQ60598 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CttnQ60598 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CttnQ60598 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CttnQ60598 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CttnQ60598 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CttnQ60598 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CttnQ60598 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CttnQ60598 Nrsn2-201ENSMUST00000079278 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.4 ms