Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZ99

Trim38, Tripartite motif-containing 38, mousemouse

Predictions only

Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trim38Q5SZ99 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim38Q5SZ99 Chpf2-202ENSMUST00000121863 3715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim38Q5SZ99 Trmt1-204ENSMUST00000109768 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim38Q5SZ99 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim38Q5SZ99 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim38Q5SZ99 Gm2420-201ENSMUST00000119864 2149 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim38Q5SZ99 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim38Q5SZ99 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Trim38Q5SZ99 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trim38Q5SZ99 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trim38Q5SZ99 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trim38Q5SZ99 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trim38Q5SZ99 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Trim38Q5SZ99 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trim38Q5SZ99 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms